军车在特定情况下可以闯红灯，主要是当它们在执行紧急任务时。根据《道路交通安全法》第五十三条的规定，执行紧急任务的军车（如警车、消防车、救护车、工程抢险车）可以使用警报器和标志灯具，并且在确保安全的前提下，不受行驶路线、方向、速度和信号灯的限制。
如果军车是在执行紧急任务时闯红灯，通常不会被视为违章行为，因此不会有交通违章记录。然而，如果军车是在非紧急任务时闯红灯，那么它将受到与一般车辆相同的交通法规约束，可能会面临罚款和扣分等处罚。
处理流程通常包括：
1. 携带相关证件到违章处理大厅办理。
2. 根据处罚决定书到指定银行缴纳罚款。
3. 保留好交款票据，并在规定时间内查询违法信息，确保违法记录被正确删除。
需要注意的是，即使是在执行紧急任务时，军车驾驶员也应当确保安全，避免因闯红灯等行为引发交通事故。