运输服务的增值税税率主要适用于一般纳税人，具体税率如下：
9%税率
适用于交通运输服务，包括陆路运输、水路运输、航空运输、管道运输以及无运输工具承运业务等。
邮政服务如邮政普通服务、邮政特殊服务和其他邮政服务也适用9%的税率。
6%税率
主要适用于现代服务业中的物流辅助服务，如货物运输代理服务、仓储服务、装卸搬运服务等。
3%税率
小规模纳税人则按3%的征收率征收增值税。
一般纳税人提供的公共交通运输服务、仓储服务、装卸搬运服务和收派服务，可以选择按照简易计税办法计算缴纳增值税。
此外，根据《印花税税目税率表》，运输合同的印花税税率为运输费用的万分之三，且不包括管道运输合同。
综上所述，运输服务的增值税税率主要适用于一般纳税人，税率为9%，而小规模纳税人则适用3%的征收率。建议在实际业务中，根据具体的业务类型和纳税人身份，选择正确的税率进行申报和缴纳税款。