员工公积金的补缴方法主要分为两种情况，具体流程和所需材料如下：
补缴期限不超过12个月
办理地点：公司住房公积金账户所在的银行公积金网点。
所需材料：
填写一式两份的住房公积金补缴书。
填写并盖章住房公积金补缴清单一式两份。
使用支票转账或现金支付。
办理流程：
公司或职工到公司住房公积金账户银行柜台进行住房公积金补缴审核。
银行专柜人员当场审核通过后收取材料，补缴完成。
补缴期限超过12个月
办理地点：
公司住房公积金开户银行所在公积金管理中心业务网点。
公司住房公积金开户银行住房公积金业务网点。
所需材料：
填写一式两份的住房公积金补缴书。
填写并盖章住房公积金补缴清单一式两份。
提供劳动部门和法院确定的劳务关系原件和复印件。
个人缴纳社保核定表的工资基数证明复印件。
使用支票转账或现金支付。
办理流程：
公司或职工到公司住房公积金账户银行柜台进行住房公积金补缴审核。
区县部门办理人员当场审核通过后收取材料。
补缴职工或单位带公积金中心审核后的材料到开户银行住房公积金业务网点专柜办理补缴手续。