进行指纹鉴定需要遵循以下程序：
申请与立案
向相关机构申请立案，并提交司法鉴定申请书。申请书应详细说明需要鉴定的指纹样本及其相关情况。
选择鉴定机构
根据法庭的安排，选择司法鉴定机构。通常通过摇号等方式确保选择的公正性。
指纹收集与比对
收集待鉴定的指纹样本，并与已知指纹进行比对，观察指纹的类型、伤痕、特殊形状等特征是否一致。
初步检验与鉴定
对指纹样本进行初步检验，寻找细节特征，并基于这些特征进行鉴定。这一步骤中，需要确定检材和样本的类型特征，寻找细节特征和其他特征，并进行比较检验。
收取结果
最后，收取鉴定结果，并根据结果进行后续的法律程序。鉴定结果通常需要1-3个月时间，复杂的案件可能会更长。
特征检验与比较
在指纹鉴定过程中，需要确定检材和样本的类型特征，寻找细节特征和其他特征。对于指纹类型的不同，则无须对该指纹作进一步检验；若指纹类型相同，则必须对纹线细节特征进行比较。这种比较通常通过特征对照法进行，确保比较的特征具有唯一性。
面积与特征考虑
指纹鉴定的标准还包括指纹面积的大小以及特征点的数量。如果指纹面积达到三分之一或二分之一以上，不论特征点多少，只要纹线流向、间隔数量相同，即符合同一认定的标准。若指纹面积小于三分之一或二分之一，则需要依赖细节特征，如“拐弯、对顶、错头、交叉”等稳定的三级特征点，来符合同一认定的标准。
符合点的评断
不仅和特征数量有关，而且和特征的质量有关。符合点的数量和质量决定了指纹鉴定的准确性。
差异点的评断
对指纹之间的差异点进行评断，区分本质差异和非本质差异。本质差异可能是否定同一指纹，而非本质差异则需要作出科学的解释。
提取指纹的方法
根据指纹留在不同材质上的情况，采用合适的方法提取指纹。例如，使用粉末法或磁粉法在非吸水性物品表面提取指纹，对于吸水性物品则需经过化学处理。
建议在整个指纹鉴定过程中，确保所有步骤都严格按照法律规定和程序进行，以保证鉴定结果的准确性和公正性。